Одна из клеймор по имени Клэр приходит в небольшой городок с заданием ликвидировать ёма. Там с ней знакомится Лаки — мальчик, родителей которого убил ёма. Лаки высказывает Клэр своё дружелюбие и надежду, что она сможет отомстить за его родителей. Клеймор, чувствуя от мальчика запах ёма, решает проследить за ним

она находит и убивает оборотня, скрывавшегося под обликом погибшего (как оказалось) брата Лаки.

Клер уходит из деревни. Жители деревни выгоняют Лаки.И мальчик следует за Клер

Путишествие выбивает Лаки из сил. Так и не нашов Клер он падает без сознания

Очнувшись Лаки находиться в гостинице. Хозяин заведенья говорит, что Клеймор искала его.Лаки устремляеться в лес,но поддавшись на обман попадает в руки Йомы, обличившейся в вид другой клеймор.
Клер его спасает, но в процесе Йома ее сильно бьет в грудь.В конце это аргументируеться как специально,но так ли это?Так начинаються странствия

Долгие недели вместе не прошли даром.Клер и Лаки сдружились,но тут вследствии нападения сильного йомы и другой клеймор,которая впоследствии пробудиться они вынуждены расстаться

Клер повержена,но ее спасает считавшееся погибшей Елена.Лаки в бегах

Благодаря тренеровками с Еленой Клер осваивает новую технику. Вскори она уходит в поисках Лаки

Организация уже три месяца не может наладить контакт с Клэр. Все это время она безуспешно ищет Раки, переодевшись мужчиной. Придя в город Ханэль, она встречает отряд клеймор под руководством №9 Джин, отправленный на уничтожение пробудившегося. Через некоторое время в город возвращается чудовищно израненая девушка-клеймор, Клэр слышит её последние слова: "Ты ведь одна из нас... Спаси их всех... пожалуйста... они ещё живы... оно слишком сильное... они что-то задумали... всех...". Клэр выходит из города, направляясь в заброшенный храмовый комплекс, где обитает пробудившийся.
Клэр врывается в подземелье, прорубаясь сквозь толпы ёма и сталкивается с принявшим истинную форму Дуфом. Оказывается, что даже с техникой "Быстрого Меча" ей не достает сил прорубить толстый панцирь врага. От верной гибели её спасает Галатея, посланная организацией найти сбежавшую Клэр. Вместе они сражаются с Дуфом, о неожиданно на сцене появляется Рифул - одна из Созданий Бездны, в присутствии которой тот дерется с утроенным усердием. Галатея посылает Клэр спасать Джин, которую держат на нижних уровнях катакомб, а сама остаётся сражаться с Дуфом. Ситуация складывается явно не в пользу клеймор...
Клер находит Джин почти полностью пробудившийся, понимает, что она опоздала, но у Джин очень сильная воля, поэтому даже в полностью пробудившемся теле её сознание все ещё человеческое. Клер помогает Джин вернуться, за что вторая считает теперь себя обязанной жизью первой. Клеймор возвращаются на помощь Галатее, которая уже почти повержена, вместе они начинают хорошо продуманную атаку, которая основана на специальной техники Джин. В итоге им практически удается повегнуть Дафа, но Рифул не может допустить смерти своего любовника, поэтому останавливает клеймор. Клер удается ранить Рифул, которая выполняет свое обещание и рассказывает Клер, где найти "девушку с рогом" Присциллу. Галатая отказывается от своего задания по поимке Клер, отпускает её и Джин.

После сражения с Дафом Клер отправляется на поиски Ислея с севера "серебряного короля". Джин следует за ней, пытаясь отплатить свой долг. Но Девушки встречают на пути своего "начальника" в сопровождении Рафаэлы. Он говорит о плачевной теперь судьбе Галатеи, а Джин и Клер за провинность отправляет на Север. Тут Клер встречает старых друзей Мирию, Денев, Хелен сообщает, что Джин одна из них. Мирия -- глава среди 24 клеймор присланых на "бойню".
Проиходит южная компания

Частично пробужденная Клэр вместе с Хелен сражаются с Ригартом. Несмотря на то, что она смогла лишить Ригарта руки, Клэр ещё не в состоянии полностью контролировать свои новые силы. Ригарт издевается, указывая на её промахи. тем временем Раки добрался до города, но увидев изменившуюся Клэр, впадает в отчаяние. В стремлении победить врага, Клэр решает пробудиться ещё немного и побеждает Ригарта, но при этом освобождается аура Терезы. Приблизившаяся к городу Присцилла почувствовала и узнала её.
Пробуждение Клэр зашло далеко, она просит Хелен убить её, пока она ещё в сознании. Напуганная воспоминаниями Присцилла, теряет над собой контроль и принимает облик в котором она убила Терезу. Силу её ёки чувствует Клэр. В гневе она вступает в поединок с Присциллой, за битвой наблюдают Ишли и Галатея. Хелен, Мириам и Денев решают поспешить на помощь Клэр. Вслед за ними на помощь идут тяжело раненная Джин и Лаки.По дороге к месту поединка выясняется причина ненависти Клэр.
Бой между Присциллой и Клэр складывается не в пользу последней. Присцилла обвиняет в смерти близких Клэр, называя её Терезой. Она ранит Клэр, но подоспевшие друзья нападают на неё. В битве с ними Присцилла высвобождает ещё больше силы, покалечив их. Чтобы защитить их и отомстить Присцилле, Клэр полностью пробуждается.
одошедшие Лаки и Джин увидели пробужденных Клэр и Присциллу. С ходом битвы ненависть к врагу делает Клэр все сильнее и сильнее — она побеждает Присциллу. Но Лаки не дает убить её, объясняя Клэр свой поступок тем, что в сущности они одинаковы — чудовищами стали из-за боли и мести. Обратившаяся, практически не контролируемая себя, Клэр едва не убивает Лаки, но его спасает Джин. Она возвращает Клэр в сознание, «возвращая свой долг» и умирает. Ишли забирает Присциллу и отпускает клеймор. Хелен, Денев, Мириам и Клэр решают покинуть организацию и пойти своими дорогами. Наблюдавшая издалека за сражением Галатея сообщает члену организации, что «я больше не чувствую их ауру» дабы организация посчитала их мертвыми. Вернувшаяся в сознание Клэр избавляется от чувства ненависти и мести, решив «жить ради дорогих тебе людей». Лаки решает сопровождать её, несмотря ни на что